У меня как бы не возникало такой необходимости, но если у тебя возникли с этим проблемы, решил создать RAR-архив и поэкспериментировать с ним. Создал папку Test, накидал в неё некоторое количество файлов и создал RAR-архив:
Кликаем мышкой по нему и он откроется в ассоциированной программе WinRAR. Открываем его и видим там файлы, которые мы туда накидали:
Далее выделяем файл (или файлы) который надо удалить, кликаем по нему правой кнопкой мыши и выбираем "удалить файл":
Таким образом, можешь отредактировать содержимое своего архива, оставить только нужное. У меня, например, после моего редактирования осталось следующее:
Если хочешь добавить файлы или папки в архив -- просто захватываешь мышкой и перетаскиваешь в открытое окно с твоим архивом.
Так что всё прозрачно и элементарно. Почему у тебя возникли напряги с этим -- хоть убей не пойму.