Сама Microsoft объяснила, что происходит на самом деле, когда вы сбрасываете Windows в исходное состояние:
- компьютер грузится в Windows RE (Среда восстановления Windows);
- Windows RE очищает и форматирует Windows разделы перед установкой чистой копии ОС;
- компьютер перезагружается в новую, чистую Windows.
Если пользователь выбирает сохранения своих файлов, происходит то же самое. Но перед тем, как очистить разделы жесткого диска, Windows RE сканирует их и помещает пользовательские файлы и настройки в другое место и лишь после перестановки Windows, возвращает обратно.
В независимости от того, решите вы сохранить свои файлы или удалить, в процессе сброса Windows к заводским настройкам, она фактически будет переустановлена. Именно поэтому все установленные вами программы будут удалены. После подобной переустановки системы нужная тебе функциональность должна восстановиться.